“八五”期间，陕财根据建立市场经济体制的需要，加强了重点学科和重点课程的建设，调整改造了一批老专业，增设了一批适应需要的应用学科和新兴专业，获准开办了注册会计师专门化方向（1994年），是全国17所有权举办该专业的高校之一；选拔了3名有突出贡献的中青年专家和22名中青年教学骨干（1993年），完善了老中青相结合的师资梯队；实行了浮动学制（1994年）；获准增设了商业经济博士点和西方经济学硕士点（1993年），获得了研究生单独考试及学位授予权（1995年）。通过改革，学院的教育结构更加合理，教育质量进一步提高。“八五”末，学院共设有15个教学系部，2个博士点，8个硕士点，26个本科专业（专业方向），1个专科专业。

“九五”期间，学科建设进一步加强，成效更为显著。尤其是在1998年，学院实现了博士后科研流动站零的突破，新增了西北地区唯一的一个应用经济学博士后科研流动站；获准增设会计学博士点，经济法学、管理科学与工程2个硕士点；取得了在职人员以同等学力申请硕士学位授予权、国家经贸委和陕西省MBA办学招生权。在教学管理改革方面，推行了按大类招生制度，实现了学生“有控制的选择专业”，实行了选课制、导师浮动制等，将竞争机制和淘汰机制逐步引入到人才培养上来。同时将教学机构调整为三院五系三部，从而理顺了专业设置，扩大了学科门类，使学院在经、管、法等学科领域逐步形成了较为完善的办学层次。“九五”末，学院共设有博士后流动站1个，博士点3个，硕士点10个，重点学科4个，本科专业18个。

大力开展基础经济理论和应用科学研究，促进科研上档次、上水平是陕财在九十年代与学科建设并重的抓手。“八五”期间，学院组织实施了科研“五个一”工程，培养选拔了一批跨世纪的中青年学术带头人和科研骨干，建立健全了优秀科研成果奖励办法；扩大了对外交流，进一步同美、英、法、俄、日、澳、加、德、匈等国家的高校建立了校际关系，达成了校际间交流合作协议，邀请了国外近百名学者来院讲学，并向国外派出百余教师进行学术交流；共完成专著16部、教材336种，发表各类论文1031篇，先后有13人经国家人事部批准享受政府特殊津贴。

“九五”期间，学院科研数量和质量进一步提高，学术实力和竞争能力显著增强，尤其是到1998年时达到历年最好。当年，学院共获得省部级优秀科研成果奖18项，其中陕西省第五次哲学社会科学优秀成果奖17项（一等奖2项，二等奖1项，三等奖14项），第四届全国统计科学技术进步奖（三等奖）1项；新申报获批立项国家哲学社会科学研究规划基金项目3项，中央其他各部门社科研究项目15项；在国内外学术期刊发表论文689篇；主办的学术期刊《当代经济科学》在中国人文社会科学引文索引（CSSCI）来源期刊的首次遴选中即入选，在全国经济研究领域的知名度与影响力日渐增强。