1979年9月，开始招收首届79级硕士研究生37名，1982年11月33名毕业，20名留校。药学专业1979年开始招收四年制本科生30名。

1987年10月，成立全国医药院校唯一的生物医学工程系并获硕士学位授权点；1994年设置三年制医学工程专业面向陕西省招生，1996年设置三年制生物医学工程专业面向全国招生。

1981年11月，被国务院学位委员会确定为首批博士和硕士学位授予单位。博士学科为生理学，硕士学科13个。

1982年12月13日成立卫生管理干部培训中心，1983年6月10日开始举办卫生管理干部专修科，面向西北地区招收学生40名，学制3年。1986年10月成立卫生管理系，继续招收三年制大专班。

1983年3月，侯宗濂教授招收第一批3名博士研究生入学，其中闫剑群于1987年12月通过论文答辩，成为医学部培养的第一位博士生。

1984年10月16日，在一、二附院分别成立医学一系和医学二系，学制五年；1988年妇幼卫生系开始招生五年制本科生20名，连续招生9年后至1996年停办。1991年12月成立第一临床医学院、第二临床医学院和口腔医学院。

1984年12月成立法医系，第二年始招五年制本科生，1996年10月在全国最早成立法医学院。

1985年3月成立卫生系，当年始招五年制本科生；1986年成立预防医学系；1997年9月成立公共卫生学院。

1985年7月，和安康、汉中地区联合举办三年制医学专业大专班，在国内开启社区定向医学教育、培养基层通科医生之先河。1997年初在原社区医学系的基础上成立社区医学院。

1985年9月和美国民间健康基金会、伯明翰阿拉巴马大学联合举办医院和卫生管理三年制硕士班1期，开启此领域中美间第一次合作。

1986年成立科技英语系，1992年更名为外语系，招收五年制本科生；1990年成为全国唯一医学英语硕士生培养点。

1987年3月成立护理系，同年开始招收五年制本科生。

1988年4月，首批试办七年制临床医学专业本硕连读班，当年招收新生24名；以后每年招生且规模逐渐扩大，直到2011年停止。

新中国成立以来，举办多种多期二年制、一年制专业班、师资班、进修班和五年制夜大学习班等，建立附设护士学校、卫生学校，形成门类、层次较齐全的学制体系。

1993年11月将基础医学部更名为基础医学院；1996年4月成立药学院。

2000年4月并入新的西安交通大学，科技英语系合组交大外语部，医学口招生专业及学制计有：临床医学七年制，临床医学、预防医学、口腔医学、法医学、护理学五年制，药学四年制。2002年设置制药工程专业本科四年制并招生；2007年开始至今每年招收“侯宗濂医学实验班”临床医学八年制本博连读生；2007年招收临床医学口腔专业七年制本硕连读生，2008年招收预防医学专业七年制本硕连读生，到2014年停止；2009年护理系改招四年制本科生；2012年起取消临床医学七年制招生。

目前高考统招全日制学制为八年、五年、四年，有3个一级学科（基础医学、临床医学、生物学）博士点，41个二级学科博士点；7个一级学科硕士点，57个二级学科硕士点。

参考文献：

王光清主编：西安医科大学五十年（1937—1987）；

《西安医科大学六十年》编写组：西安医科大学六十年；

李旭 颜虹主编：厚德尚医 为生命之光——西安交通大学医学院（原西安医科大学）辉煌70年。