新中国成立后，为适应国家工业化迅猛发展的要求，教育部对全国高校进行了大规模的院系调整，其后我校成为一所以机电为主的重工业大学，管理学院主要系科大部被调出。1950年，奉中央人民政府教育部令，管院的航业管理系被调出，与吴淞商船专科学校合并成立“国立上海航务学院”；1951年，接华东教育部决定，我校管院电信管理系调整至电机系，运输管理系调整至北方交通大学（现今的北京交通大学），财务管理系调整至上海财经学院（现今的上海财经大学）。至此，享誉东方的交大管理学院不复存在。但管理学教育并未因此终止，根据苏联的教学要求，我校专业都要学习管理，之后成立的自动化生产组织教研组承担了管理学教育的职能。1959年，中国科学院陕西分院工业经济及生产组织研究所挂靠在我校。

文革后，钱学森校友曾在科学院学部大会上建言：现在世界潮流应重视管理的发展，科学院应设立管理学部。国务院学位委员会接受了钱老的建议，认为在学位教育中应有管理学科。1980年6月，我校正式建立管理工程专业，成立管理工程教研室和系统分析教研室，准备次年招收本科生和研究生。在当时，管理工程专业被视作自然学科，属理工科性质，其目标是为培养既懂管理科学和掌握现代化科学技术手段，又懂经济的高级管理工程的人才。1981年5月，我校管理工程系成立，下设经营管理、系统方法、系统分析和管理工程四个教研室。其为文革后教育部属学校恢复最早的管理系科，汪应洛任首任系主任，同年9月4日，管理工程系首届本科生开学。1983年5月，在教育部领导下，我校积极拓展国际资源，与加拿大阿尔伯达大学签订合作协议，进行管理学教育学术交流和联合培养管理专业研究生。同时，由加拿大国际开发总署资助，管理学院派出大批年轻师资出国进修或攻读学位，另外获赠一批计算机、图书资料，成立“中-加联合培养博士生（西安）中心”。其为我校管理学科的快速发展准备了重要基础。

1984年12月，经教育部同意，我校恢复成立管理学院，是文革后最早建立的一批管理学院，其下设管理工程系、经济管理系和人口与经济研究所，由汪应洛副校长兼任院长。同年，我校管理工程学科博士点获首肯，1988年即被评为国家重点学科。1993年，经国务院学位委员会批准，我校在全国率先设立工商管理硕士点（MBA）。

于今，管理学院恢复建院已有三十周年，在学科建设、高层次人才培养和办学理念等方面，她引领了国内管理学教育的发展，在2001年及今“管理学”学科门类排名中，我校管理学院连续获第一。